但是，零式的優(yōu)點也造就了缺點，由于日本海軍提出的條件十分苛刻，同樣參與新戰(zhàn)機研發(fā)的中島公司干脆直接退出競標。而三菱公司也在零式戰(zhàn)機采用了許多極端設(shè)計，為了追求海軍提出的性能要求設(shè)計時幾乎不留任何余地，性能上幾乎就是一次性到位，在后期日本明知道零式存在種種缺點卻無法著手進行大改進。

　　1.飛機極端追求速度、機動性、航程，這就導(dǎo)致飛機減重，機身機構(gòu)采用超級杜拉鋁，全機結(jié)構(gòu)安全系數(shù)降低。飛機在高速動作下根本無法適應(yīng)帶來的應(yīng)力，零式2號機在試飛是出現(xiàn)過解體的情況，而且量產(chǎn)后還是存在這個問題。雖然日本方面很清楚這個問題并且進行過加強，但是因為設(shè)計之初就太過極端，根本沒有大改的余地，壓根就沒有從根本上解決這個問題。

　　2.還是重量的問題，為了保證低重量帶來的速度機動性航程優(yōu)點，犧牲了防御。零式的超級杜拉鋁蒙皮幾乎就沒有什么防護性能，大口徑搶就能輕易擊穿，而且杜拉鋁容易氧化，氧化后被擊中容易起火。油箱也沒有自封閉和滅火裝置，擊中后起火的問題也被人成為空中打火機，這些問題直接導(dǎo)致了日本精英飛行員的折損。

　　3.零式高速情況下機動開始惡化，速度在200英里以上開始出現(xiàn)這個問題，飛機在時速超過300公里后控制操縱桿所需要的力量急劇增大。在戰(zhàn)爭后期盟軍飛機速度和機動性不斷提升的情況下，零式的高速機動性惡化問題給他和盟軍帶來了不可彌補的劣勢。

　　4.發(fā)動機問題，在發(fā)動機整體性能不如西方的情況下還要求那么高，只能減重，減重再減重。而且中島榮12發(fā)動機在高速俯沖時浮動化油器極易出現(xiàn)問題導(dǎo)致發(fā)動機熄火。所以在空戰(zhàn)中被零式咬死，那么立即轉(zhuǎn)入高速俯沖并滾轉(zhuǎn)的動作。

　　5.高空垂直機動性出現(xiàn)惡化，動作出現(xiàn)遲滯。

　　所以，在戰(zhàn)爭中，零式因為減重帶來的防護不足問題導(dǎo)致飛機被擊中后墜毀的概率很大，飛行員折損情況非常嚴重。老飛行員損失殆盡，新飛行員訓(xùn)練和經(jīng)驗不足，短時間內(nèi)根本不能成為飛行老手。所以日本在飛行員問題上出現(xiàn)了惡性循環(huán)，飛行員整體水平越打越爛。而美軍在珊瑚海海戰(zhàn)和中途島海軍以及1942年6月找到的一架完好零式戰(zhàn)機總結(jié)出薩奇剪等戰(zhàn)術(shù)，有效的打破了零式戰(zhàn)機稱霸天空的局勢。1943年，美國F6F戰(zhàn)斗機投入使用，零式徹底沒有翻盤的希望了。1944年6月的馬里亞納海戰(zhàn)中，零式因為自身性能和飛行員水平低下的原因幾乎被完全碾壓，美軍以屠殺的方式無情的干掉零式戰(zhàn)機，此次海戰(zhàn)的空戰(zhàn)部分也被稱為馬利亞那獵火雞大賽。

　　至于零式設(shè)計的問題，只能說當(dāng)時為了追求日本一二試艦載戰(zhàn)斗機的技術(shù)要求，在發(fā)動機動力整體不足的情況下進行極端設(shè)計，將所有能用的辦法都用上了，甚至結(jié)構(gòu)上打孔去掉材料減重。這種設(shè)計方案直接導(dǎo)致后期根本就沒有改進的余地，即便日本很清楚零式存在的問題，但是根本沒有辦法。所以零式是成在速度和機動性上，但是敗也敗在機動性和速度上。戰(zhàn)爭初期零式確實是一個不錯的戰(zhàn)斗機，但是從中期開始零式開始逐步落后，后期直接被屠殺，最終淪為自殺機。